ゲノムネットワークプロジェクトクローン

ヒト完全長cDNAクローンの概要

理研ＢＲＣ・遺伝子材料開発室では、文部科学省「ゲノムネットワークプロジェクト」が収集・整備したヒト完全長cDNAクローンの提供を行っています。 ゲノムネットワークプロジェクトクローンは、次の２種類です。 1)ヒト完全長cDNAコレクション 　東京大学の菅野純夫教授ならびに理化学研究所の林崎良英領域長のグループが収集・整備。ヒトの全遺伝子の6割に相当するおよそ14,000遺伝子、約3万クローン。 2)Gateway®エントリークローン 　ヒト完全長cDNAコレクションから抜粋した6,300遺伝子分、約5万クローン。Gateway®エントリークローンのインサートDNAは、Gateway®テクノロジーにより種々のデスティネーションベクター（発現ベクター）へ簡単に移入することができます。なお、Gateway®エントリークローンには、独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発研究機構「完全長cDNA構造解析プロジェクト」において、バイオテクノロジー開発技術研究組合が作製したヒトcDNAクローンから作製したクローンも含んでいます。

これらのヒト完全長cDNAクローンを用いたプロジェクトの成果は、下記論文で発表され、クローンの詳細情報やタンパク質発現情報等がゲノムネットワークプロジェクトの公開データベース (ゲノムネットワークプラットフォーム, http://genomenetwork.nig.ac.jp/)から公開されています。

References:

1. Ota T. et al., Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat Genet. 36: 40-45, 2004.
2. Otsuki T. et al., Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. DNA Res., 12: 117-126, 2005.
3. Kimura K. et al., Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Res., 16: 55-65, 2006.
4. Itoh M., Yasunishi A., Imamura K., Kanamori M., Suzuki H., Suzuki M., Carninci P., Kawai J., Hayashizaki Y. Constructing ORFeome resources with removable termination codons, Biotechniques, 41: 44-48, 2006.

Gateway®テクノロジーについてはLife Technologies社のサイト(http://www.invitrogen.co.jp/gateway/index.shtml)をご参照ください。
Gateway® はLife Technologies社の登録商標です。
「完全長cDNA構造解析プロジェクト」にて取得されたヒトcDNAクローンについては、「独立行政法人製品評価技術基盤機構(NITE)」の「バイオテクノロジー分野(NBRC)」ホームページをご覧下さい。

■　クローン情報について
　クローンやベクターの配列はこちらからご参照いただけます。

提供の概要

利用条件：
■　学術機関の学術研究の場合

1. 研究成果の公表にあたり、以下の文献を引用する。
• ♦ Ota T. et al., Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat Genet. 36: 40-45, 2004.
• ♦ Otsuki T. et al., Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. DNA Res., 12: 117-126, 2005.
• ♦ Kimura K. et al., Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Res., 16: 55-65, 2006.
• ♦ Itoh M., Yasunishi A., Imamura K., Kanamori M., Suzuki H., Suzuki M., Carninci P., Kawai J., Hayashizaki Y. Constructing ORFeome resources with removable termination codons, Biotechniques, 41: 44-48, 2006.
2. 研究成果の公表にあたり、国立大学法人東京大学　菅野純夫教授 (Prof. Sumio Sugano, The University of Tokyo)、独立行政法人理化学研究所オミックス基盤研究領域　林崎 良英領域長 (Dr. Yoshihide Hayashizaki, RIKEN Omics Science Center)ならびにバイオテクノロジー開発技術研究組合 (Research Association for Biotechnology)に対して謝辞を表明する。
3. バイオ組合は本件リソースの使用による潜在的な第三者の特許、著作権、商標もしくはその他の所有権等の権利侵害等についていかなる保証をするものではない。利用者は、本件リソースの使用、保存、処分等によって生じるいかなる損害及び第三者からの損害賠償等の請求について全ての責任を負うものとする。
4. 研究成果の公表にあたり、次のことを明記する
   （ａ）　リソースの名称
   （ｂ）　リソースの提供元が理研BRC遺伝子材料開発室であること
   ［例、"○○○○(リソース名) was provided by the RIKEN BRC through the National Bio-Resource Project of the MEXT, Japan." または、「○○○○(リソース名)は、文部科学省ナショナルバイオリソースプロジェクトの支援に基づき、理研ＢＲＣ遺伝子材料開発室から提供を受けたものである。」］
   

クローンの作製者、バイオテクノロジー開発技術研究組合ならびにLife Technologies社の使用承諾を得る必要があるため、事前に理研BRCにご一報下さい。

提供価格：
￥8,400　（1クローン当り。ただし、学術研究機関の場合）
ベクターがpCMV SPORT6シリーズ(Gateway®発現ベクター)の場合、ライセンス料相当額\1,250を追加でご負担いただきます。ライセンスについてはこちらをご覧下さい。
ベクター情報はこちらをご覧下さい。
提供形態：
DNA（約1μg）
備考：
提供前にインサート末端配列の確認をします。
発送まで２週間のお時間を頂きます。ご了承下さい。

ゲノムネットワークプロジェクトクローンの分譲に際し、御不明な点がございましたら、「お知らせ」欄のお問い合わせ先までご連絡をお願い致します。

クローンのご依頼手順

１．クローン名の確認 ご希望の遺伝子をGenome Network Platform Viewerで検索してください。 検索結果の"Resource"欄にマークが現れる遺伝子のクローンが提供可能です。 "Resource"欄のマークをクリックし、"Clone ID"を記録してください。 完全長cDNAクローンの場合 下記検索窓から、記録した"Clone ID"を再度検索してください。 Search Full-Length Clone (IRAxxxxxxx) for "Accession"欄のリンク先が、クローンのインサート配列情報です。ご希望の配列が全て含まれるかどうか、いま一度、ご確認下さい。 "Clone ID"欄をクリックして、ベクターをご確認下さい。 ベクターがpCMV SPORT6シリーズ(Gateway®発現ベクター)の場合、ライセンス料相当額\1,250を追加でご負担いただきます。 エントリークローンの場合 下記検索窓から、記録した"Clone ID"を再度検索してください。 Search Entry Clone (W01xxxxxxx) for "Accession"欄のリンク先は、元にしたクローンの配列情報です。エントリークローンのベクターを含む末端配列は、遺伝子材料開発室までお問合せ下さい。ご依頼を頂いたクローンの末端配列確認作業を行います。 "Clone ID"欄をクリックして、ベクターをご確認下さい。 クローン毎に用いたベクターが異なります。 提供可能なクローン一覧は、こちらのリストからも確認できます。 ベクター情報はこちらをご覧下さい。 ２．生物遺伝資源提供依頼書類の入手と記入 様式 内容 ダウンロード 【書式Ａ】 遺伝子材料提供依頼書 提供依頼者の連絡先を記入してください。 ・遺伝子材料名欄1行目に「ゲノムネットワークプロジェクトクローン」、2行目以下に依頼するクローンＩＤを記入してください。 ・RDB No.欄とRestriction欄は空欄にして下さい。 PDF MS-Word 【書式Ｃ】 生物資源提供同意書 提供の依頼には、同意書への同意及び捺印が必要です。 機関長欄には公印（職印）を押せる方を記入し、公印の押捺をお願いいたします。 PDF Limited Use Label License: No.19 （Gateway® Cloning Products） ヒトGateway®エントリークローンは、Limited Use Label License No.19: Gateway® Cloning Products で保護されています。本クローンを使用した時点で、本ラベルライセンスに同意したことになりますことを予めご了承下さい。 PDF 必要事項をご記入頂き、 書式Ａ　遺伝子材料提供依頼書「１部」、 書式Ｃ　生物資源提供同意書「２部」 をお送りください。 ３．提供のご依頼 　全ての項目を記入後、書式Ａと書式Ｃを郵便にて下記宛にお送りください。 ■　お申し込み先 〒３０５－００７４ 茨城県つくば市高野台３－１－１ 理化学研究所 バイオリソースセンター 遺伝子材料開発室 ■　書類の書き方が不明の場合は下記までお問い合わせ下さい。 E-mail: dnabank@brc.riken.jp Fax: 029-836-9120 ４．提供手数料のお支払い ■ゲノムネットワークプロジェクトクローン手数料のお支払いについて 請求書は遺伝子材料発送（毎週水曜日）とは別に送付いたしますので、指定の銀行口座にお振込みください。請求書発行は筑波研究所・研究推進部・企画課が行います。 特別な様式の請求書・納品書・領収書を必要とされる場合は、申込の際にその様式の書類を必ず同封して申込みください。 支払いについての詳細は下記をご覧ください。 http://www.brc.riken.jp/inf/distribute/pay.shtml 振込み手数料につきましては、依頼者負担にてお願い致します。

お知らせとお問合せ先

■　お知らせ　■
理化学研究所バイオリソースセンターは2009年7月2日にLife Technologies社（旧Invitrogen 社）とライセンス契約を締結しました。Life Technologies社の寛大な措置によって、「Gateway®エントリークローンならびにGateway®発現クローン」に組込まれたDNAリソースのご寄託と、当センターからの学術研究への提供が可能となりました。

■　お願い　■
理研バイオリソースセンターのリソースを使用して発表された論文の掲載雑誌名、巻号頁数等の情報やPDFファイル等お送り頂ければ幸いです。

■　お問い合わせ先　■
〒３０５－００７４
茨城県つくば市高野台３－１－１
理化学研究所 バイオリソースセンター
遺伝子材料開発室
E-mail: dnabank@brc.riken.jp
Fax: 029-836-9120

Gateway® はLife Technologies社の登録商標です。

Nucleotide Sequences

Data Sheet is here.