我々のチームでは，バイオリソースセンターに収集された生物遺伝資源がどのような生物学的特徴，遺伝的性質を有しているか，という系統個々の特性情報収集のための解析技術の開発を行っています。 例えば，我が国で開発された日本産亜種マウス由来系統から新たなバイオリソースを開発し，ゲノム情報を得るとともに，これらの研究資源を利用した機能ゲノム解析技術の開発を行っています。 また，マウスを用いて生体内における遺伝子発現を可視化するための新技術・リソースの開発も行っています。
  これらのリソースを利用し，マウスの発生過程に現れる特定の細胞系譜を可視化し，時系列に沿った観察を行うとともに，実際に胚性細胞を採取して，さまざまな角度から解析を行うための一連の技術開発も行っています。 これらの解析を通じて，胚性幹細胞等に特徴的な遺伝子発現制御機構，ゲノム再プログラム化機構に関する知見を集積していきます。